Идентификовани кључни биомаркери за рану дијагнозу рака панкреаса

У недавној студији објављеној у часопису Целл Геномицс, тим истраживача из Кине спровео је студију случај-контрола како би анализирао велики панел серумских протеина како би идентификовао протеински биомаркери за

рак панкреаса у раној фази. Они су користили Менделов приступ рандомизације да би проценили потенцијалне узрочне ефекте ових протеина у развоју рака панкреаса.

Рак панкреаса је трећи водећи узрок смрти од рака, а када се дијагностикује касно, петогодишња стопа преживљавања је само 10%. Међутим, откривање рака у раним фазама може повећати стопу преживљавања на 24% -37%. С обзиром да рак панкреаса напредује споро, са просечно 11,7 година између почетне и инвазивне фазе, има довољно времена за његово рано откривање.

Традиционални биомаркери рака као што су карциноембрионални антиген и антигени угљених хидрата 19-9, 125 и 242 показали су различите специфичности за рак панкреаса. Инфламаторни протеини као што су фактор некрозе тумора (ТНФ), Ц-реактивни протеин (ЦРП) и интерлеукин-6 (ИЛ-6) такође нису показали значајну повезаност са раком панкреаса.

Тест крви који укључује све циркулишуће протеине које луче нормалне и оштећене ћелије и ткива је обећавајући метод за откривање рака, пошто абнормалности у циркулишућим протеинима често указују на развој тумора у телу.

У овој студији, истраживачи су анализирали проспективну кохорту како би идентификовали и проценили биомаркере протеина у серуму који се могу користити за откривање рака панкреаса. Учесници су укључивали 44 пара старијих одраслих особа са раком панкреаса и њихове здраве контроле, усклађене по годинама, полу, датуму вађења крви и болници. Просечна старост учесника била је 68,48 година, а 45% су били мушкарци. Подаци посматрања покривали су приближно 5,7 година.

Протеини у циркулацији су мерени из узорака серума наташте коришћењем теста проширења близине. Око 1500 протеина је измерено и квантификовано коришћењем вредности нормализоване експресије протеина (НПКС). Различите основне карактеристике као што су пушачки статус, ниво конзумирања алкохола, ниво образовања, гликемијски индекси и индекс телесне масе упоређене су између случајева рака панкреаса и њихових здравих контрола да би се идентификовале категоричке варијабле.

Вредности експресије протеина су стандардизоване и за сваки протеин су израчунати односи шанси. Поред тога, подаци о рибонуклеинској киселини (РНА) из ГТЕк пројекта коришћени су за испитивање профила експресије гена сваког протеина у 54 ткива. Анализе осетљивости су такође урађене након стратификације података према полу и прилагођавања за дијабетес типа 2.

Подаци из УК Биобанк Пхарма Протеомицс Пројецт коришћени су за анализу репликације кључних протеинских биомаркера. Поред тога, коришћен је Менделов приступ рандомизације да би се проценили потенцијални узрочни ефекти идентификованих протеина у развоју рака панкреаса.

Студија је идентификовала четири протеина повезана са раком панкреаса: фосфолипаза А2 група ИБ (ПЛА2Г1Б), фактор некрозе тумора (ТНФ) и чланови породице регенерирајућих протеина (РЕГ) 1А и 1Б. Од њих, РЕГ1А и РЕГ1Б протеини су потврђени коришћењем података из УК Биобанк. Поред тога, Менделове анализе рандомизације које користе податке о асоцијацијама на нивоу генома и локусе квантитативних особина показале су узрочне ефекте РЕГ1А и РЕГ1Б на развој рака панкреаса.

Анализа колокализације за РЕГ1 протеине открила је умерене доказе да рак панкреаса и РЕГ1 протеини имају заједничку узрочну варијанту. Штавише, Менделова анализа рандомизације није пронашла доказе о другим узрочним варијантама које утичу на везу између РЕГ1 протеина и рака панкреаса.

РЕГ1 протеини су такође пронађени на повишеним нивоима код карцинома плућа и једњака. Ови протеини се синтетишу у β-ћелијама Лангерхансових острваца у панкреасу и учествују у развоју дијабетеса и регенерацији ћелија острваца.

Истраживачи су претпоставили да тумори или лезије у панкреасу стимулишу пролиферацију β-ћелија, што доводи до абнормалног лучења РЕГ1 протеина. Поред тога, домен лектина Ц-типа присутан на РЕГ1 протеинима може да се веже за угљене хидрате на површини туморских ћелија и подстиче малигни раст.

У овој студији, истраживачи су испитали циркулишуће протеине да би идентификовали потенцијалне биомаркере за рак панкреаса. Идентификована су два протеина, РЕГ1А и РЕГ1Б, који имају узрочне ефекте у развоју рака панкреаса и такође су повишени код рака плућа и једњака. Ови резултати истичу потенцијал РЕГ1А и РЕГ1Б протеина за употребу у раном откривању и широком скринингу рака панкреаса.