Људски папилома вирус је озбиљна опасност. Дијагноза је неопходна да би се одредио синдром инфекције и ризик његовог онкогеног деловања. Такве информације омогућавају израду најприкладнијег и ефикаснијег плана лечења.
Дијагноза хламидије са ПЦР-ом је најосетљивији и специфичнији метод који се тренутно користи у лабораторијама. Сензитивност методе је 95-97%, а специфичност је 95-98%.
Микоплазме су класификоване као условно патогени микроорганизми. Они настају и паразитирају на мембранама епителних ћелија и могу се локализовати и екстра- и интрацелуларно.
ПЦР дозвољава да се утврди присуство ДНК гонококса директно и квантитативно изражава њихова концентрација у тестираном материјалу. Испитивани материјал може бити спутум, течност за лаваге, урин, пунктата из различитих органа и циста итд.
Дијагностичка сензитивност ПЦР за детекцију Хелицобацтер пилори у биопсијским узорцима слузнице желуца је 88-95,4%, специфичност је 100%; у кофрофилтратима - 61,4-93,7% и 100%, респективно.
За разлику серолошке дијагностичким методама туберцулосис који детектују антитела на Мицобацтериум туберцулосис, ПЦР може открити Мицобацтериум туберцулосис ДНК директно и квантитативно изразе своју концентрацију у материјалу.
Недавно, за дијагностику ХСВ инфекције коришћењем идентификација ДНК ХСВ 1 и 2 у материјалу везикуле и улцерација коже или мукозних мембрана (коњуктивитиса укључујући оку) помоћу ПЦР (веома осетљивих, специфичних и брзо дијагностичка метода).
Директна квантификација ХИВ РНК помоћу ПЦР-а омогућује прецизније прогнозирање брзине развоја болести код људи инфицираних ХИВ-ом, тачније од броја ЦД4 + ћелија, те стога прецизније процјењује њихов опстанак. Висок садржај честица вируса обично се повезује са израженим оштећењем имунолошког статуса и малим садржајем ЦД4 + ћелија.