Сваки примарни липопротеин карактерише присуство у свом саставу појединца, само инхерентног протеина (аполипопротеин). Аполипопротеини означени су латиничким словима, од којих су неке породице протеина и такође су означене бројевима (на примјер, апо-А1, апо-А2, итд.).