Најчешће псеудомембранозни колитис развија под утицајем продужене употребе антибиотика ампицилин, линкомицин, Клинда-митсина, цефалоспорине, најмање - пеницилин, еритромицин, хлорамфеникол, тетрациклин. Цлостридиум диффициле - споре формирања Грам-позитивне анаеробна бациллус, који је у стању да произведе две врсте егзотоксине токсин А и токсин Б. Постоје четири главна разлога за развој псеудомембранозног колитиса повезаног са Ц. Диффициле.