ЕЕГ анализа се врши током снимања и на крају након његовог завршетка. Током снимања процени присуство артефаката (са циљем линија актуелних области, механичке артефаката електрода покрета, електромиограм, електрокардиографске, итд), предузима мере да их елиминише. Процењују се фреквенција и амплитуде ЕЕГ-а, идентификују се карактеристични графички елементи, одређује се њихова просторна и временска расподела.