Симптоми малабсорпције витамина Б12 настају од првих месеци живота детета. Они примећују слабост, бледост, кашњење у физичком развоју, дијареју. После 6-30 месеци после појаве првих симптома, примећују се неуролошки поремећаји: ментална ретардација, неуропатија, миелопатија.